L'eau peptonée est un milieu liquide utilisé pour la culture de micro-organismes non fastidieux et le test de l'indole.
C'est également un milieu de base auquel on peut ajouter des hydrates de carbone et un indicateur pour les études de fermentation. Ce milieu n'est pas destiné à être utilisé pour le diagnostic de maladies ou d'autres conditions chez l'homme.