Clostridium difficile est une bactérie à Gram positif, anaérobie, sporulée, qui est une cause fréquente de diarrhée et de colite associées aux antibiotiques. Il s'agit d'un agent pathogène largement étudié dans la recherche médicale et scientifique, et il est disponible dans une variété de formats pour être utilisé dans les expériences de laboratoire.