Les échelles d'ADN ont des tailles définies avec des incréments exacts entre les bandes. Les échelles ne sont pas destinées à être utilisées pour des analyses quantitatives.
Les fragments d'ADN peuvent être colorés au bromure d'éthidium.
L'échelle d'ADN de 50 pb comporte 16 fragments d'ADN allant de 50 pb à 800 pb par incréments de 50 pb, plus un fragment "backbone" de 1 800 pb. Toutes les bandes, à l'exception de la bande de 800 pb, sont d'intensité égale ; la bande de 800 pb est ≈3 fois plus intense.